SARS-CoV-2 : de nombreuses co-infections fongiques pulmonaires ?

Sur les 27 premiers patients admis en soins intensifs entre le 16 et 28 mars, ils ont réalisé un lavage bronchoalvéolaire ou des aspirations bronchiques, pour dépister une éventuelle pneumonie fongique. Neuf patients sur 27 (33 %) étaient atteints d’une d’aspergillose pulmonaire invasive. Signalé pour la première fois avec la grippe H1N1, l’aspergillose pulmonaire représente une complication fréquente (20-30 %) et précoce (médiane de 3 jours après l’admission en soins intensifs) chez des patients ayant des formes graves de la grippe, entraînant une aggravation de la maladie ainsi que de la mortalité. Mais dans ce cas la surinfection fongique est attribuée à l’effet direct sur l’immunité anti-Aspergillus des antiviraux utilisés pour traiter les formes graves de la grippe(2,3). Une publication d’une équipe de Cologne trouve des résultats similaires. Elle a examiné rétrospectivement les dossiers de tous les patients atteints de COVID-19 admis dans les unités de soins intensifs médicaux ou chirurgicaux. Une aspergillose pulmonaire invasive a été trouvée pour 5 des 19 patients(4). Quand nous reprenons l’analyse des 5 premiers patients français bien décrits, le patient décédé avait une co-infecion à Aspergillus flavus(5). Cela confirmerait la prévalence élevée de l’aspergillose pulmonaire invasive chez les patients ayant des formes graves de COVID-19. Dès le 6 avril un éditorial de la Société française de mycologie médicale informait sur la nécessité de chercher des infections fongiques invasives chez les patients ayant une forme sévère de COVID-19(6). Leurs recommandations sont détaillées dans l’encadré ci-dessous. L’infection au SARS-CoV-2 est d’une complexité rare et le traitement des patients ayant une forme grave n’est pas encore bien codifié. Le recherche puis le traitement des co-infections fongiques semblent indispensable. O. C. Le 29 avril 2020 Références 1. Alanio Al et al. High Prevalence of putative invasive pulmonary aspergillosis in critically ill COVID-19 patients (April 14, 2020). Available at SSRN: https://ssrn.com/abstract=3575581 or http://dx.doi.org/10.2139/ssrn.3575581 2. Wauters J et al. Invasive pulmonary aspergillosis is a frequent complication of critically ill H1N1 patients: a retrospective study. Intensive Care Med 2012 ; 38 : 1761-8. 3. Schauwvlieghe AFAD et al. Invasive aspergillosis in patients admitted to the intensive care unit with severe influenza: a retrospective cohort study. Lancet Respir Med 2018 ; 6 : 782-92. 4. Koehler P et al. COVID‐19 associated pulmonary aspergillosis. Mycoses (First published:27 April 2020) https://doi.org/10.1111/myc.13096 5. Lescure FX et al. Clinical and virological data of the first cases of COVID-19 in Europe: a case series. Lancet Infect Dis 2020 Mar 27. pii: S1473-3099(20)30200-0. 6. Gangneux JP et al. Invasive fungal diseases during COVID-19: we should be prepared. J Mycol Med (6 avril 2020), https://doi.org/10.1016/j.mycmed.2020.100971 Avec le soutien institutionnel du laboratoire